เกาะหลีเป๊ะเป็นเกาะที่มีการก่อตั้งชุมชนที่เก่าแก่ที่สุดขึ้น ตั้งแต่สมัยรัชกาลที่ 5 ผู้ที่ร่อนเรอยู่กลางทะเลและเกาะอื่นๆ เริ่มมาตั้งรกรากอยู่บนเกาะหลีเป๊ะแห่งนี้